В дневное время суток, Томас Андерсен – работает в солидной компании по разработке программного обеспечения, а вот ночью он превращается в неуловимого хакера под ником Нео. Постоянная жизнь под маской двуличия, и хроническая усталость подкашивают Томаса, и он начинает сомневаться в реальности происходящего, да и всего мира, в общем. Он не может найти свое место в этом мире, где ему было бы хорошо.

Но все в жизни кардинально меняется, после всего лишь одного сообщения на компьютер главного героя. В нем было написано только четыре слова «Ты увяз в Матрице». После чего на него постоянно давят правительственные агенты с одной стороны, и преступники с другой. И каждая из группировок пытаются склонить Нео, на свою сторону. С ним связывается опасная преступница Тринити, и предлагает прийти на встречу с неуловимым кибер террористом Морфеусом. Который сможет ответить на все вопросы, что мучают Томаса последнее время.

И вот наступает момент сложнейшего выбора. Синяя таблетка – сотрет все воспоминания о последнем происходящем, и красная таблетка – позволяющая вырваться из заключения в матрице, и посмотреть на настоящий мир и что с ним произошло на самом деле.

Нео не смог отказаться от соблазна, который позволит ему узнать правду. И вот он видит настолько пугающую реальность. Весь тот мир, в котором он жил и работал, это всего лишь иллюзия, созданная и поддерживаемая суперкомпьютером. Вся планета Земля лежит в жутких руинах, а её жители порабощены могущественной расой машин, которые используют людей для производства энергии. Лишь крупица сопротивления скрывается в катакомбах под землей. И Нео должен стать главой сопротивления, так как он избран предначертаниями судьбы.